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Arbol filogenetico de los hominidos
chimpanz
ResumenDurante los últimos 150 años, la diversidad y las relaciones filogenéticas de los hominoideos han sido uno de los principales focos de atención de la investigación biológica y antropológica. A pesar de ello, el estudio de los factores implicados en su radiación evolutiva y en el origen del clado de los homínidos, un tema clave para la comprensión de la evolución humana, permanecía en su mayor parte inexplorado. Aquí abordamos cuantitativamente estos acontecimientos utilizando métodos filogenéticos comparativos y datos morfométricos craneofaciales de especies de homínidos existentes y fósiles. En concreto, exploramos modelos evolutivos alternativos que nos permiten obtener nuevos conocimientos sobre este proceso de diversificación del clado. Nuestros resultados muestran un escenario complejo y variable que implica diferentes regímenes evolutivos a lo largo de la radiación evolutiva de los homínidos -modelados por el régimen multiselectivo de Ornstein-Uhlenbeck y los escenarios de movimiento browniano multirracional-. Estos diferentes regímenes evolutivos podrían estar relacionados con distintos factores ecológicos y culturales previamente sugeridos para explicar la evolución de los homínidos en diferentes escalas evolutivas a lo largo de los últimos 10 millones de años.
gorilas
Un árbol filogenético, también conocido como filogenia, es un diagrama que representa las líneas de descendencia evolutiva de diferentes especies, organismos o genes a partir de un ancestro común. Las filogenias son útiles para organizar el conocimiento de la diversidad biológica, para estructurar las clasificaciones y para proporcionar una visión de los eventos que ocurrieron durante la evolución. Además, dado que estos árboles muestran la descendencia de un ancestro común, y dado que muchas de las pruebas más sólidas de la evolución vienen en forma de ascendencia común, hay que entender las filogenias para poder apreciar plenamente las abrumadoras pruebas que apoyan la teoría de la evolución.
Los diagramas de árbol se han utilizado en la biología evolutiva desde la época de Charles Darwin. Por lo tanto, se podría suponer que, a estas alturas, la mayoría de los científicos se sentirían muy cómodos con el “pensamiento arbóreo”, es decir, con la lectura e interpretación de las filogenias. Sin embargo, resulta que el modelo arbóreo de la evolución es algo contraintuitivo y se malinterpreta con facilidad. Tal vez por ello, los biólogos sólo han llegado a desarrollar en las últimas décadas una comprensión rigurosa de los árboles filogenéticos. Esta comprensión permite a los investigadores actuales utilizar las filogenias para visualizar la evolución, organizar su conocimiento de la biodiversidad y estructurar y guiar la investigación evolutiva en curso.
árbol filogenético de humanos y chimpancés
Para su comodidad, las secuencias descargadas previamente se incluyen en un archivo MAT. Tenga en cuenta que los datos de los repositorios públicos se curan y actualizan con frecuencia; por lo tanto, los resultados de este ejemplo pueden ser ligeramente diferentes cuando se utilizan secuencias actualizadas.load(‘primates.mat’)
Construir un árbol filogenético UPGMA usando métodos de distanciaCalcule las distancias entre pares usando la fórmula ‘Jukes-Cantor’ y el árbol filogenético con el método de distancia ‘UPGMA’. Como las secuencias no están prealineadas, seqpdist realiza un alineamiento por pares antes de calcular las distancias.distances = seqpdist(primates,’Método’,’Jukes-Cantor’,’Alfa’,’ADN’);
Construir un árbol filogenético de unión de vecinos utilizando métodos de distanciaEs importante considerar topologías de árbol alternativas cuando se analizan secuencias homólogas entre especies. Se puede construir un árbol de unión de vecinos utilizando la función seqneighjoin. Los árboles de unión de vecinos utilizan la distancia entre pares calculada anteriormente para construir el árbol. Este método realiza la agrupación utilizando el método de evolución mínima.NJtree = seqneighjoin(distances,’equivar’,primates)
filogenia de la evolución humana
Los Hominidae (/hɒˈmɪnɪdiː/), cuyos miembros son conocidos como grandes simios[nota 1] u homínidos (/ˈhɒmɪnɪdz/), son una familia taxonómica de primates que incluye ocho especies existentes en cuatro géneros: Pongo (el orangután de Borneo, el de Sumatra y el de Tapanuli); Gorila (el gorila oriental y el occidental); Pan (el chimpancé y el bonobo); y Homo, del que sólo quedan los humanos modernos[1].
Varias revisiones en la clasificación de los grandes simios han hecho que el uso del término “homínido” varíe con el tiempo. El significado original de “homínido” se refería únicamente a los humanos (Homo) y a sus parientes más cercanos extinguidos. Sin embargo, en la década de 1990, los humanos, los simios y sus antepasados se consideraban “homínidos”. El anterior significado restrictivo ha sido asumido en gran medida por el término “hominino”, que comprende a todos los miembros del clado humano tras la separación de los chimpancés (Pan). El significado actual del siglo XXI de “homínido” incluye a todos los grandes simios, incluidos los humanos. Sin embargo, el uso varía, y algunos científicos y legos siguen utilizando “homínido” en el sentido restrictivo original; la literatura académica muestra generalmente el uso tradicional hasta alrededor del cambio de siglo XXI[5].